Пилотным проектом инжинирингового центра железнодорожного транспорта является проект по разработке высокоскоростного поезда для соединения крупных Российских городов. В рамках Программы мероприятий по сотрудничеству между ОАО «РЖД», АО «Группа Синара», АО «Роснано» в сфере разработки транспортной системы на водородном топливе в Инжиниринговом центре реализуются предпроектные работы по созданию тягового подвижного состава, использующего водород в качестве топлива. Для решения задачи по увеличению ресурса и снижению времени обслуживания железнодорожных линий сформирован проект по разработке конструкций и технологий содержания железнодорожного пути, обеспечивающих наработку 2,5 млрд. тонн брутто пропущенного тоннажа.